肺泡蛋白沉着症表現是非特異性的,應與以下疾病相鑑別: ①特發性肺間質纖維化; ②肺泡癌; ③粟粒性肺結核; ④肺實質性疾病如病毒性肺炎、支原體肺炎及衣原體肺炎。
PAP的胸部X線表現需與肺水腫、肺炎、肺黴菌病、結節病、肺部結締組織病、矽肺、卡氏肺囊蟲肺炎及IPF等相鑑別。
(一)發病原因
肺泡蛋白沉着症病因未明。推測與幾方面因素有關：如大量粉塵吸入(鋁，二氧化硅等)，機體免疫功能下降(尤其嬰幼兒)，遺傳因素，酗酒，微生物感染等。而對於感染，有時很難確認是原發致病因素還是繼發於肺泡蛋白沉着症。例如鉅細胞病毒，卡氏肺孢子蟲，組織胞漿菌感染等均發現有肺泡內高蛋白沉着。
雖然啓動因素尚不明確，但基本上同意發病過程爲脂質代謝障礙所致。即由於機體內、外因素作用引起肺泡表面活性物質的代謝異常。到目前爲止，研究較多的有肺泡巨噬細胞活力，動物實驗證明巨噬細胞吞噬粉塵後其活力明顯下降，而病員灌洗液中的巨噬細胞內顆粒可使正常細胞活力下降，經支氣管肺泡灌洗治療後，其肺泡巨噬細胞活力可上升。而研究未發現Ⅱ型細胞生成蛋白增加，全身脂代謝也無異常。因此目前一般認爲本病與清除能力下降有關。
(二)發病機制
1.肺泡蛋白沉着症的發病機制目前尚不完全清楚，有以下幾種假設：
(1)表面活性物質清除障礙：電鏡觀察發現肺泡蛋白沉積物和全肺灌洗物在結構上與由Ⅱ型肺泡上皮細胞分泌的含有層狀體的肺泡表面活性物質非常相似，提示肺泡蛋白沉積物可能與肺泡表面活性物質代謝障礙有關。目前大多數證據表明肺泡蛋白沉積物可能是由於肺泡表面活性物質清除障礙所致，而不是產生過多。正常情況下肺泡表面活性物質(SP)的產生與清除是一個複雜的動態過程，肺泡Ⅱ型上皮細胞不僅合成和分泌肺泡表面活性物質，而且還與肺泡巨噬細胞一道參與肺泡表面活性物質的清除，當某些因素如感染、藥物等可使肺泡Ⅱ型細胞的功能發生改變，導致其對肺泡表面活性物質的清除能力降低，從而引發了表面活性物質在肺泡內的沉積。最近的研究還發現表面活性物質蛋白A(SP-A)不僅可調節表面活性物質的分泌而且還可調節肺泡Ⅱ型上皮細胞和肺泡巨噬細胞對肺泡表面活性物質的再攝取，其在PAP發病機制中的作用目前尚不清楚。
(2)肺泡巨噬細胞功能缺陷：許多學者發現肺泡蛋白沉着症患者的肺泡巨噬細胞存在着化學趨化活性低、吞噬功能和吞噬溶酶體活性下降等情況，Gonzalez等報道正常人的肺泡巨噬細胞與肺泡蛋白沉着症患者的肺泡灌洗液共同培養時，正常人的肺泡巨噬細胞就會喪失吞噬能力，提示肺泡蛋白沉着症患者的肺泡灌洗液中存在着抑制肺泡巨噬細胞的因子。最新研究表明肺泡巨噬細胞功能缺陷可能與粒細胞巨噬細胞集落刺激因子(GM-CSF)不足或與GM-CSF/IL-3/IL-5受體β鏈缺陷有關。
(3)繼發於其他疾病：臨牀上有些疾病特別是血液系統惡性腫瘤可發生肺泡蛋白沉着症，如髓白血病、淋巴瘤、Fanconi貧血以及IgG型免疫球蛋白病等。雖然文獻報道血液系統惡性腫瘤發生繼發性肺泡蛋白沉着症的平均發病率約5.3%，但急性髓白血病患者繼發該病的發生率可高達10%。與原發性肺泡蛋白沉着症不同，繼發性肺泡蛋白沉着症的病變往往呈局竈型，而且症狀輕微，通常不需要行支氣管肺泡灌洗治療。
(4)吸入物的異常損傷 文獻報道肺泡蛋白沉着症可能與某些理化因素和礦物粉塵吸入有關，如白消安、苯丁酸氮芥、矽塵和鋁塵等。動物吸入矽塵顆粒也可引起肺泡蛋白沉着症這些都提示肺泡蛋白沉着症可能與某些理化因素和礦物粉塵吸入有關，但在人類，流行病學研究尚無直接證據表明肺泡蛋白沉着症與上述物質有關。
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