在診斷時，不要過份依賴腫塊表面不平和質地堅硬作爲甲狀腺癌的特徵。有些甲狀腺癌的腫塊可以很柔軟，光滑，活動度也大，這在乳頭狀腺癌中並不少見。相反，鈣化嚴重的甲狀腺癌瘤、結節性甲狀腺以及硬化性甲狀腺炎質地較硬，表面有顆粒感，易誤診爲甲狀腺癌。認爲甲狀腺結節囊性病變都屬良性，這顯然是不全面的。有報道囊性病竈惡變率爲1.4%，甲狀腺癌的囊變率也隨其結節長大而增高。
131Ⅰ或99mTc甲狀腺掃描只能反映出結節的形態及其攝取同位素功能，不能確定其性質。但從臨牀資料表明，在熱結節、溫結節、涼結節和冷結節的掃描圖象中，甲狀腺癌的可能性循序依次遞增。掃描可檢出0.5cm以上的結節，如其喪失攝取同位素的功能，可無考慮爲甲狀腺癌(應經超聲檢查排除囊腫的存在)，但要注意甲狀腺癌並非都表現爲冷結節。此外，同位素分佈的缺損與腫瘤的大小有關，有時功能減損的腫瘤圖象可被正常甲狀腺組織所掩蓋。少數甲狀腺癌顯示爲熱結節。
上述檢查不能確診時，可行細針抽吸細胞學檢查，宜在手術前1日進行，診斷符合率高。在10%病例中不能作出進一步的細胞分類，仍需手術探查，作組織學檢查。
對甲狀腺髓樣癌，可應用血清降鈣素測定以及給鈣或五肽胃沁素刺激試驗來作出診斷。
個別病人所患的甲狀腺癌惡性度較高，首先表現爲轉移癌而腫大的頸淋巴結，原發甲狀腺癌反而未被病人察覺，一般說來，甲狀腺單髮結節較多髮結節或結節性甲狀腺腫更有可能爲惡性。病人有下列表現者應警惕癌性結節的可能。
①在地方性甲狀腺腫非流行區，14歲以下兒童的甲狀腺單個結節，其中10%～50%是惡性。但都是分化好的甲狀腺癌。
②成年男性甲狀腺內的單髮結節。
③多年存在的甲狀腺結節，短期內明顯增大。
④濱海居住的患者，單髮結節爲癌的機會遠比來自地方性甲狀腺腫流行區的患者爲高。
⑤兒童期頭頸部曾接受過放射治療的患者，甲狀腺單個結節更可疑。
⑥查體表現結節質地堅硬，固定不規則或伴同側頸部淋巴結腫大。聲帶麻痹。
⑦頸部拍片示甲狀腺內的鈣化陰影爲雲霧狀或顆粒狀。邊界不規則，甲狀腺癌導致的氣管狹窄常常是左右徑、前後徑可以正常。
⑧B超檢查呈實性或囊實性，內部回聲不均勻，邊界不清楚和不規則。
⑨穿刺檢查發現腫瘤細胞，對囊性腫物抽出液可能逐漸變爲暗紅色，這是甲狀腺乳頭腺癌轉移竈的一種特徵。
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